PS3:sta puuttuu BD Java, joka on Sony BDP S550 ja S350-malleissa. BD Javaa tarvitaan lähitulevaisuudessa voidakseen hyödyntää Blu-ray-levyjen interaktiivisia toimintoja. PS3:sta puuttuvat myös useimmat uudemmat audio-muodot, kuten Dolby TrueHD, DTS-HD Master Audio jne.